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Ciencia
Gnuplot	Gráficas de funciones matemáticas en dos y tres dimensiones.	Más info...
Maxima	Motor de álgebra computacional con múltiples funcionalidades.	Más info...
Scilab	Scilab es un software libre de cálculo numérico especialmente diseñado para aplicaciones científicas y de ingeniería	Más info...

Diseño y Publicidad
Blender	Diseño, modelado y creación de gráficos tridimensionales.	Más info...
Dia	Diseño y creación de diagramas de diversas clases, mapas y más.	Más info...
Gimp	Poderoso editor digital de imágenes y fotografías.	Más info...
GhostScript	Muestra, impresión y conversión de archivos PostScript y PDF a otros formatos.	Más info...
Inkscape	Editor de gráficos vectoriales basado en el formato libre SVG.	Más info...
Scribus	Diagramación de páginas, folletos, periódicos y más	Más info...
YafRay	Renderizado de imágenes	Más info...

Infantiles
Rili		Más info...
TuxPaint	Aprendizaje de dibujo (Tipo Paint)	Más info...

Educación
Geogebra	Aprendizaje de geometría y algebra	Más info...
Squeak	Aplicación aprendizaje de técnicas de utilización del teclado	Más info...
VYM	Aplicación para creación de mapas mentales y mapas colaborativos.	Más info...
Xlogo	Implementación del lenguaje Logo, enfocado a niños y jovenes	Más info...

Internet
Ares	Descarga de archivos e información vía P2P.	Más info...
Azureus	Descarga de archivos e información vía bittorent.	Más info...
Emule	Descargas de archivos e información vía P2P.	Más info...
Firefox	El mejor navegador WEB con amplias funcionalidades.	Más info...
Pidgin	Aplicación para mensajería instantánea (MSN, Yahoo, Gmail, IRC, etc, ...).	Más info...
Seamonkey	Suite de Internet conformada por varias aplicaciones y características	Más info...
Xchat2	Cliente de IRC derivado de XChat	Más info...

Juegos
Brutal Chess	Ajedrez con gráficos 3D.	Más info...
Enigma	Juego de ingenio, hay que encontrar rocas de diversos tipos	Más info...
SuperTux	Juego de plataformas similar a Super Mario.	Más info...

Audio y Video
Audacity	Mezclas, combinaciones y edición de audio en diversos formatos.	Más info...
MusikCube	MusikCube es un completo organizador y reproductor de audio	Más info...
MPlayer Classic	Reproductor de audio y video basado en la interfaz de Windows Media Player antiguo, muy funcional	Más info...

Oficina
Abiword	Completo editor de texto, maneja formatos como .doc y .rtf.	Más info...
GNUmeric	Excelente aplicación para manejo de múltiples formatos de hoja de cálculo	Más info...
OpenOffice.org	Completa suite de ofimática (Texto, Presentaciones, Hojas de Calculo, etc, ...).	Más info...

Programación y creación de aplicaciones
Eclipse	Entorno de desarrollo en Java para varios lenguajes. Muy extensible a partir de plugins	Más info...
Python	Sofisticado lenguaje de programación pero con gran facilidad de aprendizaje.	Más info...
RapidSVN	Interfaz gráfica para manejo y uso de SVN (Subversion)	Más info...

Redes
FileZilla	Manejo ágil y sencillo del protocolo de red FTP	Más info...
Nmap	Efectuar rastreo de puertos TCP	Más info...
PuTTY	Manejo para archivos a través de protocolos de red TELNET (SSH) desde una terminal.	Más info...
Wireshark	Aplicación para monitoreo de redes con amplia funcionalidad.	Más info...

Utilidades varias
7-Zip	Compresor y extrator de archivos compresos (zip, rar, tar, bz2, gzip y más).	Más info...
CamStudio	Aplicación libre que permite grabar vídeos directamente del escritorio del computador	Más info...
ClamWin	El primer antivirus libre para Windows, excelente funcionalidad y soporte.	Más info...

Diseño y desarrollo WEB
WAMP5	Instalador de Apache, PHP y MySQL, todos desde un mismo archivo	Más info...